海南省在推动渔业高质量发展过程中，面临一些挑战，尤其是在实现从传统渔业向现代渔业的转型升级过程中。这些挑战主要来自以下几个方面：

1、资源环境压力：随着全球气候变化和人类活动的影响，海洋环境日益恶化，海洋生物资源日益减少，这对依赖海洋资源的渔业产业构成了威胁。

2、产业发展不均衡：海南省的渔业产业发展存在一定的不均衡性，例如，近岸工厂和池塘养殖的尾水污染较大，深远海养殖和捕捞装备相对较弱，这些都对渔业的可持续发展构成了挑战。

3、技术难题：现代渔业工厂化养殖需要依赖先进的科技手段，如精准饲养、智能监控等，而海南省在这方面的技术水平和设施设备还存在一定的差距。

4、政策环境：尽管海南省政府已经出台了一系列鼓励渔业转型升级的政策措施，但在实施过程中仍面临一些困难和挑战，如政策执行不到位、配套设施不完善等。

为了应对上述挑战，海南省正在积极寻求解决方案，比如加强科技创新，推动渔业设施装备的升级，优化产业布局，加强环境保护等。同时，海南省也在积极探索和实践渔业的绿色化、智能化发展路径，以期在保护环境的同时，实现渔业产业的持续、健康发展。